第一阶段：糖酵解（Glycolysis）

糖酵解发生在细胞质中，是所有生物体共有的代谢途径。在这个过程中，葡萄糖被分解成两分子的丙酮酸。这一阶段不需要氧气，因此也被称为无氧呼吸的一部分。

反应方程式：

\[ C_6H_{12}O_6 \rightarrow 2C_3H_4O_3 + 2ATP + 2NADH + 2H^+ \]

第二阶段：柠檬酸循环（Citric Acid Cycle）

柠檬酸循环，又称克雷布斯循环，发生在细胞的线粒体基质中。在这个阶段，丙酮酸被进一步氧化，生成二氧化碳、水，并产生更多的能量载体（如NADH和FADH2）。

反应方程式：

\[ 2C_3H_4O_3 + 6NAD^+ + 2FAD + 2ADP + 2Pi \rightarrow 4CO_2 + 6NADH + 2FADH_2 + 2ATP \]

第三阶段：电子传递链与氧化磷酸化

这是呼吸作用的最后阶段，也是能量产生的主要阶段。在这个过程中，NADH和FADH2将电子传递给电子传递链中的蛋白质复合体，最终与氧气结合生成水。同时，通过氧化磷酸化过程，大量ATP被合成。

反应方程式：

\[ 2NADH + 2FADH_2 + O_2 + H^+ \rightarrow 2H_2O + 2NAD^+ + 2FAD + 34ATP \]

通过这三个阶段，生物体能够有效地从有机物中提取能量，满足各种生理需求。这些复杂的化学反应不仅展示了生命的精妙之处，也为科学研究提供了丰富的研究方向。